第一、首付款计算方式不同
办理新房贷款时，首付款是按照购买时的市场价作为参考，并根据个人贷款次数和个人贷款的信誉程度进行多方面的审核来制定贷款比例。
而与新房贷款相区别的是，办理二手房屋贷款是根据“二手房评估价”作为参考。所谓评估价是根据当时的市场情况，通过银行指定的专业评估机构进行房产价值评估而计算出来的。一般二手房评估价低于市场价。评估价大多为二手房市场价值的80%-90%，部分房屋会更低。
第二、税费不同
购房新房需要缴纳契税与城市维护建设税。
购房二手房需要缴纳契税、营业税、个人所得税(房屋不满五年)。
第三、交易方式不同
新房交易主要是自行交易
二手房交易有自行交易和委托交易两种方式
第四、交易风险大小不同
二 手房是能看得到摸得着的，在户型，房屋质量、交通、环境、周边生活设施等方面均一日了然，而且所处的社区环境一般都比较成熟，因此房屋质量及配套设施方面 的交易风险较小。但二手房交易在产权方面的纠纷往往多于新房交易，比如说夫妻一方擅自处置夫妻共同财产、共有人未经其他共有人同意处置共有财产、有些二手 房比如经济适用房等交易有诸多限制等。现实生活中，在签订合同甚至是房屋过户后，经常出现其中一方或第三方主张合同无效或要求解除合同等情况。
新 房交易，尤其是期房交易，购买的时候可能只看到了开发商的广告、沙盘、样板间、效果图，除此之外，都是开发商关于新房的各种各样的承诺，而房子是尚不存在 的。等将来房子真正建起来的时候，和开发商当初的承诺可能并不完全吻合，甚至有些承诺根本就不能实现，如户型变化、面积增加或减小等。所以，当新房真正建 起来时可能会与购买者的心理预期有一定差距，而且，部分新房还可能存在各种质量问题，如墙面渗水、墙体裂缝、地板不平整等，在与开发商协商不成的情况下.要 求赔偿损失或退房将浪费大量的时间和精力。相对于二手房交易而言，新房在房屋质量及配套设施方面的交易风险较大。但由于出卖方是开发商，而且是初次交易， 因此产权方面的纠纷较少，新房交易的纠纷多表现在开发商逾期交房、逾期办理产权等，而开发商主张合同无效或解除合同的情况很少。
第五、程序繁简不同
就交易过程而言，二手房交易尤其是自行交易时，很多程序都需要买变双方自行完成，因此相对较为繁锁，而新房交易很多程序都由开发商办理，因此从这个角度对于购房者而言，新房交易的程序要简单一些。