目前对太阳能热水器储水的安全性还没作过检测，但考虑到热水器的材质和水管生锈等因素，为慎重起见，最好不要拿来当作饮用水。
太阳能热水器里的水不是天天更换，可能带来二次污染。太阳能热水器属于金属物，若长时间不清洗，亦可能产生污染。建议市民不要饮用太阳能热水器里的水，饮用对人体健康不利。
太阳能热水器水箱内胆，一般采用SUS3042B的食品级不锈钢，也就是做不锈钢饭盒的材料，如果是正规厂家的热水器产品，能确保用的是食品钢的话，饮用没问题，这是对水箱内胆来说；其次是真空管，一般是全玻璃真空管，直插式的，构造如同暖瓶胆，真空镀层在最内层玻璃的相对面，与水是隔绝的，和暖瓶的保温原理一样，所以对于真空管来说对水没污染，可以饮用；然后就是真空管与水箱相接的地方用来密封用的硅胶圈，材料与医用装生理盐水和葡萄糖的瓶子塞类似，所以对水也不会产生污染。一般在夏天甚至春末或秋初，热水器中的水很容易就能被加热至沸腾，理论上讲，太阳能热水器里的水是可以饮用的。但是要注意以下几点：
1、不是直插式的要注意，比如是承压热水器，多数是阳台壁挂式的，因为采用紫铜管做承压循环水路，会有铜绿产生，对人体健康有影响；
2、由于成本原因，许多小一些的太阳能厂家在用料上挂羊头卖狗肉，用不符合饮用水卫生安全标准的不锈钢、硅胶圈，而且由于发泡技术不过关，聚氨脂保温层不能与水完全隔离，这样的热水器里边的水是坚决不能饮用的，刷锅洗碗都不行。
3、如果热水器许多天没有用过，里边的水也不能饮用。
太阳能热水的确为人民的生活用水提供了方便，但是太阳能热水器的水箱内储存的水属二次储水，使自来水中本来用于消毒杀菌的余氯，经一段时间的储蓄后会自然分解，起不到消毒的作用；其次，由于水箱中的水经热反应后温度升高，长期在热水浸渍中会使得箱内的涂层、粘胶和塑料输水管发生一些化学反应，一些有害物质会被释出，并溶于水中；再有国家对塑料输水管分有‘可供生活饮用’和‘不可供生活饮用两类，但绝大多数太阳能热水器的输水管没有明确的批文，许多用户自购房起就把太阳能热水器视为小区应有的配套设备，而没仔细核对相关的产品质量报告。因此提醒大家，在不明确的情况下最好不要将太阳能热水用于与入口有关的生活饮用类，如洗菜、做饭、烧开水等，更不能直接饮用，仅用于洗浴、洗衣、打扫家庭卫生是可以的。