一般施工单位进场后肯定是要先对设计文件即施工图进行复测，包括水准点和导线点的测量，如果施工方发现设计方给出的水准点和导线点有误，或是施工单位觉得现状地形标高和设计文件上的自然地面标高有太大较大偏差，都可以要求甲方向设计单位发涵，要求设计单位自己复核，如果真有问题就要出变更，这就关系到工程量和造价的问题。像你所说的情况，应该是设计单位没有对现场进行详细的踏勘，应该是设计的问题。可以向甲方提出意见，也可以监理反应。不过一般也都是和甲方进行协商看是重新修改设计出变更还是以实际发生量为准。不过，工期紧，一般确是以实际发生工程量为准。